基于整合的生物信息学分析鉴定与膀胱癌上皮间质转化相关的新型预后标志物

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaolan
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膀胱癌是全世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,具有较高的发病率和复发率。本研究的目的是利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和多种生物信息学的整合分析来识别与膀胱癌进展相关的新的预后生物标记物。首先,我们在274例TCGA膀胱癌患者中使用WGCNA构建了一个基因共同表达网络,并初步筛选了4个与临床特征相关的基因(CORO1C、TMPRSS4、PIK3C2B和ZNF692)。并在数据集GSE19915中124名患者的标本作为验证集用于验证WGCNA选择的基因。随后,CORO1C和TMPRSS4被证实为膀胱癌患者中具有预后值的枢纽基因。此外,基因集富集分析(GSEA)和基因集变异分析(GSVA)的结果表明,CORO1C和TMPRSS4可能参与上皮间质转变(EMT)的过程并且二者作用相反。CORO1C的高表达与肿瘤浸润中性粒细胞(TINs)显著相关,TINs是一种负调节成分,促进肿瘤的远处进展,并导致不良的临床结果。总之,我们的研究通过确定CORO1C和TMPRSS4是通过影响EMT作为在肿瘤进展过程中的重要调节因子,并可在未来的膀胱癌治疗中作为有效的提示预后的生物标志物和治疗靶点。
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