农村医疗保障是整个社会保障制度的重要组成部分，是农民生命质量提高的标志，是有关农民生存及发展的基本问题。然而我国医疗保障制度的改革一直未将农村人口纳入思考的范围，农民以绝对的低收入，承担着自费医疗的重负，因病致贫、因病返贫的现象相当普遍。2002年中央在全国农村卫生工作会议上做出《中共中央、国务院关于进一步加强农村卫生工作的决定》，要在农村地区逐步建立起由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度，即新型农村合作医疗制度。决定发布以后，各地根据中央政策开展了相应的试点工作，在实践中结合各自实际情况制定和完善了新型农村合作医疗制度管理办法和实施方案，使试点工作取得了积极的成效。目标，是到2010年实现在全国建立基本覆盖农村居民的新型农村合作医疗制度，减轻农民因疾病带来的经济负担，提高农民健康水平。但是，作为一项复杂的系统工程，这项制度的建立不可避免地遇到了各种各样的困难与问题。有鉴于此，笔者对农村医疗保障制度的研究以时间为顺序，从过去的历程回顾到当前的现实困难进行全面分析，转型期我国农村医疗保障制度分析离不开对其历史的分析，农村医疗保障制度是在政治、经济、社会以及文化诸因素约束下农民、政府以及医疗服务机构的一种利益平衡。从农民、政府和合作医疗机构三方的博弈来看，政府面临着筹资、组织、资金管理等方面的压力，农民因为自身的特点面对着是否参加农村合作医疗的选择，合作医疗机构则因缺乏对其有效监督而成为危及到新农合制度是否能可持续发展的焦点。因此，建立并完善现在的农村合作医疗制度，使之成为一项政府有动力、有能力建立并管理，农民有参合意愿，合作医疗机构得到有效监督并能提供相应医疗服务能力的医疗制度成为我们研究的重点。笔者通过定量和定性相结合的方法，分析了新型农村合作医疗对农民卫生服务利用、农民家庭医疗卫生支出以及医疗服务提供机构的影响；分析了农民参加合作医疗及受益的影响因素、新型农村合作医疗发展的主要障碍、实施过程中存在的问题及原因，并最终为新型农村合作医疗制度的发展提出了政策建议。