自2004年禽流感在广西爆发后，迅速肆虐中华大地，并波及全世界众多地区。不断发生的禽流感疫情，一方面既暴露了基层兽医队伍的薄弱和动物卫生管理体制的不健全，又暴露了地方政府应对禽流感等公共危机存在的机制缺失和体制脆弱，如危机管理法治的缺失、危机预警意识缺乏、公共财政政策制订存在缺陷、政府和公众间危机联动机制缺乏、公共危机信息处理失当等。另一方面又极大地激发、催化动物卫生管理体制及公共危机应对机制的改革，要求建立健全基层畜牧兽医队伍，完善以官方兽医制度为主的动物卫生管理体制；建立统一危机决策指挥体系，完善应急合作与联动机制；建立财政物质保障机制，完善公共危机信息管理机制；建立动物疫情应急预案，完善危机管理应急机制。 目前温州市应对禽流感等公共危机尚未形成一套完善的管理机制，一些地方政府在应对和处置公共危机时常常手足无措。本论文应用公共管理、政策分析、行政学理论，采用系统分析法和归纳法，系统地论述了温州市动物卫生管理体制及政府公共危机管理机制存在的问题，分析比较了国内外动物卫生管理体制及公共危机管理的差异，提出了建立健全温州市动物卫生管理体制和公共危机管理机制的相关建议。