2008年美国次贷危机发生后,进而迅速扩散到全球范围引起金融危机,这次金融危机充分暴露了金融机构的经营风险。而银行业作为重要的金融机构,受到人们的高度重视,巴塞尔委员会为了更好的维护银行体系的稳定性修订了巴塞尔新资本协议。其中,资本充足率作为巴塞尔新协议的核心,越来越受到各国市场经济体的重视。纵观各国商业银行资本充足监管的历史可以看出,银行资本充足监管就是资本充足率与银行效率的相互博弈。银行资本充足监管既要达到资本充足率要求,维护银行的稳定性；又要预防高的资本充足率要求影响银行效率的提升。为了分析我国当前资本充足监管情况,选取我国13家商业银行作为样本,运用DEA方法和财务指标分析法分别对我国商业银行效率进行分析；然后建立面板数据模型,运用EVIEWS6.0对我国商业银行资本充足率与银行效率关系进行实证研究。研究显示：我国商业银行资本充足率与基于DEA方法分析得到的综合效率呈现倒u型关系；与基于财务指标分析中盈利能力指标呈正向相关关系,而与流动性指标、安全性与资本质量指标呈负相关关系。基于当前我国商业银行的现状以及上述实证分析结果,为了协调我国商业银行资本充足率与银行效率的关系,针对资本充足监管和银行效率两个方面提出意见和建议。资本充足监管应当与国际监管体系接轨,完善监管体制保持资本充足监管的有效性；优化银行效率要做到提高资本积累能力,同时提高商业银行自身的经营管理能力。协调资本充足率与银行效率的关系才能够更好的维护我国商业银行的可持续发展。