目的:收集胆管结石患者行ERCP术前及术后粪便,进行肠道菌群检测、分类,了解肠道菌群失调与胆结石形成的关系,并了解ERCP手术对患者肠道菌群的影响。方法:选取2016年12月至2017年10月在我科住院符合纳入标准的28名患者,收集其手术前及手术后粪便标本,用试剂盒提取粪便细菌基因组DNA,根据细菌的16SrDNA基因序列设计引物,运用RT-PCR方法,定性、定量检测出细菌的变化。并进一步与38位正常人的肠道菌群基因组作对比,明确正常人与胆结石患者肠道菌群组成结构是否存在差异性。结果:本研究中我们从所有样本总计获得157721条高质量、可分类的细菌16S rRNA基因序列,鉴定了4652个细菌OUT数。最终从胆管结石患者中鉴定了11个细菌门类群,其中Firmieutes(厚壁菌门)、Proteobacteria(变形菌门)和Bacteroidetes(拟杆菌门)至少占了构成比中75%以上,和120个细菌属类群,其中Enterococcus(肠球菌属)、Escherichia/Shigella(大肠杆菌/志贺氏菌属)、Bifidobacterium(双歧杆菌属)、Bacteroides(拟杆菌属)、Faecalibacterium(柔嫩梭菌属)占了构成比30%以上。与BMC Genomics已报道的38位中国正常患者的肠道菌群基因组作对比后发现,在细菌门水平上,胆结石患者肠道内P roteobacteria(变形菌门)明显高于正常人,在细菌属水平上,Roseburia、Lachnospiracea、Faecalibacterium三种菌属在胆结石患者肠道内与正常人存在明显差异(P<0.05),显著低于正常人。然而ERCP前后两组样本间肠道菌群无明显差异性,P>0.05。结论:人类肠道菌群的多样性,肠道菌群失调与胆结石形成有一定的相关性,胆管结石患者ERCP术后肠道菌群无明显变化。