由青枯雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）引起的青枯病是茄科蔬菜作物上的一种毁灭性土传病害。由于青枯病菌存在丰富的种内遗传多样性和明显的致病力分化,给该病的准确诊断和防治带来许多困难,至今尚无有效的解决办法。因此，开展青枯菌的快速诊断技术研究及其遗传多样性研究对于将来的抗病品种选育和综合防控具有十分重要的理论指导意义。本研究从海南省各地茄子、番茄、辣椒作物上分离获得了47个青枯病菌菌株，其中12株为海南省不同地区的菌株，35株为同一块田地的青枯病菌株。运用特异性引物Y2/OLI1对分离的青枯病菌株进行了PCR扩增检测，同时对其中一个菌株的16SrDNA片段进行了序列分析。结果表明，该对引物从茄子、番茄、辣椒作物上分离的青枯病菌株DNA中扩增出了大小约为300bp的特异性片段。 PCR检测结果与16SrDNA片段的测序结果一致，证实该PCR检测技术可用作茄科蔬菜青枯病菌的快速准确的检测手段。运用REPIR-I/REP2-I、ERICIR/ERIC2和BOXA1R三对通用引物对分离获得的47个青枯病菌菌株进行了遗传多样性分析。基因组指纹图谱分析结果表明，不仅来自不同地区的菌株呈现很高的遗传多样性，而且来自同一田块的菌株也表现明显遗传多样性。比较三种引物的指纹图谱，显示三种引物都具有较丰富的图谱多态性。BOXA1R引物相对于其他两种引物产生的图谱多态性更多一点。菌株之间丰富的遗传多样性表明该菌田间种群结构复杂多样，也提示其可能在不利环境因素的影响下遗传分化和变异明显。