松花江沿江湿地生物多样性丰富，具有重要的生态功能。近几十年来，由于受到人类生产活动的强烈影响，沿江自然湿地退化严重，改变了湿地土壤正常的发育过程。本文以黑龙江省富锦市松花江下游沿江湿地为研究对象，通过对不同水文和不同土地利用方式下土壤微生物群落结构和活性特性及其主要影响因子的研究，揭示湿地退化过程的驱动机制，为退化湿地恢复提供理论依据；筛选湿地土壤健康评价微生物学指标，为湿地土壤退化与修复评价指标与指标体系的完善提供科学依据与基础数据。主要结论如下：1.采用磷脂脂肪酸技术（PLFA, Phospholipid fatty acids）研究发现，松花江下游沿江退化湿地土壤中磷脂脂肪酸以单不饱和脂肪酸、直链饱和脂肪酸和支链饱和脂肪酸为主，羟基脂肪酸、环丙烷脂肪酸和多不饱和脂肪酸含量较少；微生物群落结构中细菌占明显优势（占44.8%～52.6%），其次是真菌（5.3%～8.2%），放线菌最少（1.9%～5.6%）；在不同水文条件下和不同土地利用方式下，微生物总PLFA量和功能类群的特征PLFA几乎都呈现显著差异性。2.在不同退化湿地中，微生物生物量碳、蔗糖酶、脲酶和磷酸酶都呈现出不同程度的差异性。土壤水分和养分条件对微生物活性具有重要的影响。3.在不同水分条件的自然湿地中，影响土壤微生物群落结构和活性的主要土壤环境因子有；土壤水分、总磷、总氮、速效磷和速效钾，但是在利用方式不同的湿地中则主要包括土壤水分、有机碳、速效磷和速效钾。4.总PLFA、细菌和微生物生物量碳可作为湿地土壤健康评价的微生物学指标。