近年来,我国金融发展迅速,许多地区都出现了金融集聚现象。区域内的金融资源、金融机构和金融人才的高度聚集,在该区域内形成了巨大的规模经济效应和范围经济效应,为区域的发展创新起到了很大的促进作用。因此,探究金融集聚对于区域创新效率的影响机制能发掘新经济形势下的区域发展的内在动力。文章理清金融集聚对于各个阶段创新效率的影响作用,从而分析不同区域的创新效率差异,给出合理建议。对此,文章研究金融集聚对于区域创新效率的影响作用,通过进行理论分析和数据现状分析,发现目前三大区域创新效率存在的问题,并从作用方向、作用程度和作用的时间关系三方面进行实证研究。对于区域创新活动而言,分为“创新投入—创新技术—创新效益”三大步骤,因此区域创新效率分为两大部分:一是创新技术转化效率,二是创新效益转化效率。并重新建立区域创新效率评价体系,运用DEA—BCC模型来进行效率测算。文章先是根据银行业、保险业和证券业的基本作用来探讨其对区域创新效率的影响作用,然后通过数据分析找到目前全国范围和三大区域两阶段创新效率存在的问题,再运用面板多元回归模型来探讨变量之间的基本关系,最后运用PVAR模型进行脉冲响应分析研究变量之间深层次的动态关系。得到以下结论:第一,三大金融行业的集聚程度存在区域差异,整体而言呈现出东部集聚程度最高,中西部较低的情况。第二,三大区域的创新技术转化效率趋于一致,而创新效益转化效率存在差异。第三,银行业集聚、保险业集聚和证券业集聚对创新技术转化效率能产生促进作用,且具有地区差异。第四,对创新效益转化效率起促进作用的主要是证券业集聚。第五,消费水平对两个阶段的创新效率起到一定的抑制作用。第六,根据脉冲响应分析,银行业集聚、保险业集聚和证券业集聚对于创新技术转化效率和创新效益转化效率的影响效应具有时滞性和持续性特点。最后,给出相关的针对性的政策建议。