基于液相芯片技术的血栓相关基因多态性检测方法

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血栓疾病严重危害人类的健康,血栓疾病类型大体上能够分成动脉血栓和静脉血栓。所有血栓发病机理的中心点是止血过程的紊乱,凝血.纤溶系统保持动态平衡,人类就不会罹患血栓疾病。这种平衡由遗传因素,环境因素以及二者的相互作用决定。研究表明,遗传因素在血栓性疾病中发挥重要的作用,并受到日益广泛的重视。血栓形成相关基因单核苷酸多态性的分析有利于患者疾病进程的预测和健康人血栓相关疾病的预防,此外,大范围的血栓形成相关基因单核苷酸多态性的分析对血栓疾病的研究和临床工作具有重大的意义。   液相芯片即多功能悬浮点阵仪,是既能保证信息质量,又能提供相对高通量的新的分子检测技术平台。其整合了有色微球、激光技术、应用流体学、快速信号处理数据分析系统,故特异性和灵敏度较高。目前,该技术已广泛应用于免疫分析、核酸研究、酶学分析及受体与配体的识别分析等领域中。   基于Luminex100多功能悬浮点阵仪平台,我们和同济医学院的科研人员合作,设计并建立了一种快速、多重而可靠的血栓相关基因突变的检测技术。我们选择了5种凝血-纤溶系统相关因子的9种基因改变作为检测目标,其中包括8个单核苷酸多态性(SNP)位点和1个插入突变位点:纤维蛋白原β链-455G/A突变、纤维蛋白原β链-148位C/T突变、纤维蛋白原β链448位G/A突变、凝血因子Ⅶ-400位G/A突变、凝血因子Ⅶ353位R/Q突变、凝血因子VLeidenG/A突变、凝血酶原20210位G/A突变、亚甲基四氢叶酸还原酶677位C/T突变和凝血因子Ⅶ10bp插入突变。我们收集同济医院临床血栓患者血液样本261份和健康人血液样本73份总计334份样本,其中深静脉血栓样本(DeepVenousThrombosisDVT)119份,脑血管疾病样本(CerebrovascularDiseaseCVD)33份,急性心肌梗塞患者样本(AcuteMyocardialInfarctionAMI)76份,冠桩动脉疾病(CoronaryArteryDiseaseCAD)样本33份,健康对照样本(NormalN)73份。我们根据选定的9种目的基因多态性位点的特点设计特异性引物及探针,通过两轮PCR,分子杂交,再用Luminex100系统进行检测,从而确定检测样本基因多态性的情况。之后,随机和重点结合对已检测样本进行测序,以验证判读结果。本论文对每一种基因多态性检测了20份样本,总共检测180份样本。测序纤维蛋白原β链-455G/A突变样本5份、纤维蛋白原β链-148位C/T突变样本6份、纤维蛋白原β链448位G/A突变样本6份、凝血因子Ⅶ-400位G/A突变样本5份、凝血因子Ⅶ10bp插入突变样本4份、凝血因子Ⅶ353位R/Q突变样本7份、凝血因子VLeidenG/A突变样本9份、凝血酶原20210位G/A突变样本6份、亚甲基四氢叶酸还原酶677位C/T突变样本11份共59份样本次。实验结果表明,我们开发的液相芯片技术对选取的全部基因中的8种目的基因多态性的检测结果明确,且与抽样测序的结果符合率100%,可以用来准确的检测目的基因的多态性。但还有1种基因即纤维蛋白原β链-455G/A位点的检测结果阳性值较低,需要进一步优化。
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