【摘 要】
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旨在利用全基因组关联分析(GWAS)搜寻与金华猪总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)相关的候选基因。本研究以205头金华猪为样本,通过提取血样DNA并利用Illumina猪50K SNP芯片进行基因型分型,利用PLINK v1.09对获得的基因型数据进行质控后用于GWAS研究。采用混合线性模型(MLM)和FarmPCU模型,对每个SNP和目标性状做关联分析,定位出显著位点。同时对两种模型的GWA
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旨在利用全基因组关联分析(GWAS)搜寻与金华猪总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)相关的候选基因。本研究以205头金华猪为样本,通过提取血样DNA并利用Illumina猪50K SNP芯片进行基因型分型,利用PLINK v1.09对获得的基因型数据进行质控后用于GWAS研究。采用混合线性模型(MLM)和FarmPCU模型,对每个SNP和目标性状做关联分析,定位出显著位点。同时对两种模型的GWAS结果进行比对,探讨两个模型的优劣。候选基因功能注释通过基因富集分析、网络分析和通路分析。结果表明:FarmPCU模型检测到了大多数MLM检测到的显著SNPs显示出更高的统计效力。本研究共检测到35和18个SNPs分别与TNB和NBA显著关联,其中有16个SNPs与这两个性状都相关,最终找到了 26个候选基因,所检测到的基因多与细胞发育、组织稳态、细胞增殖、蛋白质修饰、mRNA代谢、大脑发育和磷酸化等基本的生物学功能有关,也证明几个基因与繁殖性状有关。根据基因功能注释初步鉴定NANOS1、AEBP2、CAPZA3、KRAS、NDP和HOOK1基因是TNB和NBA性状的候选基因。本研究结果为进一步解析繁殖性状的遗传机制提供了新的线索,并可能利于在未来的育种计划中改进这些性状。
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光遗传学是一种结合了多个学科的新兴技术,通过使目标细胞表达特定的光敏感蛋白,可以让原本不具有光敏特性的细胞获得对光信号的响应能力。通过光遗传学方法可实现对细胞内信号通路的精准调控,并诱发相应的生理活动。该技术具有精准、快速、可逆等优点,可以帮助我们更好的了解与利用细胞的生命活动。RTCA(Real-Time Cell Analysis,实时细胞分析)系统是结合了ECIS(Electric Cell
随着集成电路制造工艺的进步与算力需求的提升,单位面积内集成的晶体管数量日益增加,电路高速运转产生的巨大功耗已经成为限制芯片应用的主要难题。低功耗设计是当前集成电路面临的巨大挑战,本文从数字后端设计的层次出发,研究相应的功耗优化技术,实现对某款40 nm芯片的功耗优化。本文提出了一种高效的多位寄存器聚类合并算法,嵌入到后端设计流程中,简化了时钟树结构,完成了该芯片中53.53%的寄存器合并,将绕线总
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沙门氏菌、大肠杆菌等微生物严重困扰着家禽养殖业和人类的生命健康。近几十年抗生素的大量使用,导致动物产品中抗生素残留以及耐药菌群的产生。因此研究具有抗菌功效的抗生素物显得尤为重要。天然抗氧化物葡萄籽原花青素(Grape seed proanthocyanidins extract,GSPE)因其具有较强的抗炎作用,日益受到人们的关注,作为抗生素替代品具有较大的潜力,但鲜见GSPE在家禽卵巢炎症方面的
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肿瘤坏死因子受体相关因子3(TNF receptor associated factor 3,TRAF3)是肿瘤坏死因子受体相关因子(TNF receptor associated factors,TRAFs)家族的重要成员,是连接上游受体信号与下游抗病毒信号通路的重要转导蛋白,在脊椎动物的抗病毒先天免疫过程中起着重要作用。先前的研究大多阐明了 TRAF3在哺乳动物,鸟类和鱼类中的功能,但对于两栖
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