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本文研究制药废水新工艺以及采用高效降解菌进行废水处理生物强化技术，首次应用生物滤池和序批式活性污泥法相结合的工艺来处理含难生物降解污染物的制药废水。比较了两种生物滤池：生物滴滤池(BF)和升流式厌氧生物滤池(UAF)在制药废水处理中的特性，采用BF与SBR配对，进而对SBR法的工艺参数进行调试，确定生物滤池和SBR组合工艺的最佳运行参数。探讨了组合工艺中生物膜的耐冲击负荷能力、生物膜对进水可生化性的提高、生物膜对好氧SBR污泥性能的影响、pH对系统去除效果的影响等工艺条件。在日处理94.2L的小试规模废水生物处理反应器上研究生物滤池和SBR法相结合的处理工艺对含抗生素类制药废水处理的可行性。 本研究在对废水处理工艺进行优化的同时，也有针对性地对废水中重要污染物的高效降解微生物进行驯化、筛选、分离。包括降解杂环类化合物茶碱的高效降解菌、抗生素类化合物交沙霉素的高效降解菌和解热镇痛类药物扑热息痛的高效降解菌。采用16SrDNA序列分析法及传统的生理生化特征鉴定法对茶碱高效降解菌Tcn3鉴定的结果表明，菌株Tcn3在细菌系统发育分类学上属于副球菌属的善变副球菌(Paracoccus vesutus)，这一菌种的发现在国内尚属首次。对交沙霉素的降解研究表明，单一的菌株无法将交沙霉素彻底地降解，但可以使交沙霉素的抑菌效价大大地降低，富集菌群可以将交沙霉素彻底地降解。菌株P1对扑热息痛具有强的降解能力，对于提高含扑热息痛废水的处理效果具有应用意义。 在生物滴滤池和SBR反应器组合工艺中投加优势降解菌，考察了生物强化效果。结果表明，当投菌量为处理系统有效容积的0.2％时，处理系统对制药废水COD和有机污染物的去除效果有明显的提高。