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用RAPD技术分析了江西赣州地区(瑞金，兴国，赣县，于都，会昌5个采样点)水域鲤鱼遗传多样性。在25个随机引物中，筛选了11个多态引物，对赣州地区5个采样点水域鲤鱼进行PCR扩增。根据遗传相似率和遗传距离，重建了5个县域鲤鱼之间的亲缘关系。11条多态引物，PCR扩增共得到条带1772条，其中特异性条带占总条带数百分比达到85.04％。在种群水平上，平均期望杂合度(He)，Shannon指数(I)和多态位点百分率分别为0.27088，I=0.39562，PPB=66.20％。在物种水平上，平均期望杂合度(He)，Shannon指数(I)和多态位点百分率(PPB)分别为0.3232，0.4789，PPB=85.01％。其中，瑞金地区鲤鱼(RJ)群体相对其他三个群体遗传多样性较高(H=0.2919；I=0.4241；PPB=70.3％)。从遗传距离表和UPMGA系统发生树上发现：各群体间的遗传距离(SD)在0.1371-0.2192之间，平均遗传距离为0.17636，各群体间的遗传相似系数(SI)在0.8032-0.8719之间，平均遗传相似系数0.8418。Nei’s遗传多样性分析表明群体间基因流水平较低(Gst=0.3217；Nm=1.0541)。以上说明，赣州地区各县域鲤鱼群体发生了一定的分化。其中，瑞金地区和兴国地区两群体亲缘关系最为紧密，而瑞金地区和会昌地区两群体亲缘关系较远。从实验结果来看，系统分化以及基因交流的影响主要来自于地理环境因素。