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政府与大学的关系一直是高教界关注的核心问题，正确处理政府与大学的关系对大学的发展有着至关重要的影响，有利于推动高等教育健康有序地发展。论文介绍了帕森斯的结构功能主义，研究了结构功能主义视角下政府与大学的关系包括三方面，一、是政府要对大学进行宏观管理；二、是政府要赋予大学正常运行所需的权力；三、是大学要按照自身的运行规则运行。论文按照结构功能主义下政府与大学的关系分析了近代政府与北京大学的关系，即清政府与京师大学堂的关系、北京政府与北京大学的关系和国民政府与北京大学的关系，并对这三对关系进行比较，总结出政府与大学的关系的有益经验。最后论文关于目前政府与大学的关系存在着的问题给出启示。