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采用20对微卫星标记对缙云麻鸭与绍兴鸭3个品系的遗传结构进行了分析。结果表明缙云麻鸭与绍兴鸭群体的平均杂合度为0.5946~0.6918,试验共检测到178个等位基因。在DA基础上的UPGMA法聚类图将4个品系聚类为2个类群,聚类结果与各品种的生态地域分布和经济类型有着一定的关系。研究结果为缙云麻鸭种质特性研究提供了基础,也为中国家鸭资源的合理保护和开发利用提供了科学依据。