【摘 要】
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本试验旨在扩增抗纤维连接蛋白Ⅲ型结构域蛋白5(Fibronectin TypeⅢDomain Containing Protein 5,FNDC 5)基因的编码序列(Coding Sequence,CDS),通过生物信息学软件分析FNDC5
【机 构】
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山西农业大学动物科学学院,山西 太谷 030801
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本试验旨在扩增抗纤维连接蛋白Ⅲ型结构域蛋白5(Fibronectin TypeⅢDomain Containing Protein 5,FNDC 5)基因的编码序列(Coding Sequence,CDS),通过生物信息学软件分析FNDC5的特性,并分析该基因在晋汾白猪不同组织中的表达情况.选取1日龄晋汾白猪,以背最长肌cDNA为模板克隆FDNC5基因的CDS序列,利用生物信息学方法分析FNDC5的结构和功能,采用qRT-PCR检测FDNC5基因在晋汾白猪不同组织中的表达水平.结果表明,猪FDNC5基因的CDS序列有843 bp,共编码280个氨基酸.生物信息学预测,FNDC5为亲水性蛋白,二级结构中α螺旋、β转角、延伸链和无规则卷曲分别占31.79％、4.64％、20.36％和43.21％.qRT-PCR结果显示,FDNC5基因在肌肉、肝脏和心脏中高表达,在其他组织中的表达量较少.本研究结果为进一步探讨猪FDNC5基因的功能提供了参考依据.
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