国际航运中心建设是上海城市发展的基本功能定位，也是虹口“创新驱动，转型发展”的强大动力，而优质完善的法治环境和法律服务则是上海国际航运中心建设的重要条件。
　　2011年7月，虹口区检察院成立了全市亦是全国首家航运案件专业化办理机构——航运（金融）检察科，积极探索“捕、诉、防、研”于一体的专业化办案模式。近五年来，虹口区检察院在航运领域共受理审查批捕案件298件518人；受理移送审查起诉707件1101人。
　　为了营造公平有序的航运发展环境，虹口区检察院出台司法保障航运发展意见，明确航运检察工作的目标任务，增强工作的责任感和使命感。与此同时，加大刑事打击力度。严厉打击发生在水上运输、船舶租赁、仓储服务、航运保险、现代物流等航运领域的各类刑事犯罪，积极参与整顿和规范航运市场经济秩序，增强社会安全感。妥善办理“11·3东海大桥特大交通肇事案”、海洋量子号、歌诗达赛琳娜号国际邮轮盗窃案等有较大社会影响的案件。办理的上海港集装箱系列盗窃案被评为全市检察机关首届“服务大局保障民生”十佳案例。
　　为了充分发挥检察机关打击、预防、监督等职能作用，虹口区检察院严肃查办职务犯罪。在办案中发现，航运发展領域的职务犯罪行为往往发生在港口基础设施建设、航运企业改造升级、报关服务等环节。虹口区检察院针对高发领域加强查处力度，近年来共查处职务犯罪案件74件78人，总案值达10922余万元。不断加大法律监督力度，共追捕47人，追诉53人，制发纠正违法通知书5份，提出检察建议9份。分别与上海港公安局、上海水上公安局签订《关于对航运领域内刑事案件加强执法监督配合的工作协议（试行）》，完善公检协作配合机制。
　　航运领域社会治安防控体系建设具有其特殊性，找准切入点、着力点才能起到事半功倍的作用。虹口区检察院延伸检察职能，积极参与航运领域综合治理。首先，针对执法办案中发现的法律适用不同意、案件管辖权不明等问题，积极建言献策，形成统一的法律适用意见，为同类案件办理提供有益借鉴。其次，针对航运监管漏洞，加强风险预警提示。近年来，洋山港区和外高桥港区发生卡车或黑车驾驶员在承运集装箱业务中实施诈骗案件（俗称“飞单”），通过检察建议形式，建议加强货运物流行业整治，建立统一的行业标准。最后，紧密结合司法需求，形成执法合力。走访调研司法机关、航运主管部门、行政执法单位和航运企业，充分了解行业特点和司法需求，加强沟通配合。与上海水上公安局、中海长兴船厂共同开展“警、检、企合作警民接待日”活动，加强法制宣传。
　　作为上海市唯一一家航运金融领域专业化办案机构，虹口区检察院航运（金融）检察科职能更加明确、定位更加准确、资源有效整合，为服务航运中心建设提供了有力司法保障。