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细菌在生长繁殖时,细菌蛋白的表达受到环境影响而存在较大差异,使得细菌蛋白表达具有复杂性.在食品生产加工过程中可能会受到致病菌污染,细菌产生的内毒素和外毒素均会对人体健康构成威胁,因此需要高灵敏度和高特异性的检测方法来定量分析和鉴定食品中的细菌毒素.蛋白组学方法可以揭示细菌蛋白组成及其潜在的生物学功能,感染过程中菌体蛋白表达变化和致病机制.其中,细菌蛋白样品的前处理作为细菌蛋白组学研究的关键步骤,直接影响鉴定的细菌蛋白质量.本文主要阐述目前细菌蛋白组学研究中菌体蛋白和胞外蛋白样品制备方法及其对蛋白鉴定和定量的影响,将为更深入地开展细菌蛋白组学研究提供参考.