基于乳腺癌ChIP-seq数据的p53抑癌机制研究

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：peterstone138

【摘要】

：

采用生物信息学方法分析野生型p53乳腺癌MCF7细胞的Ch IP-seq（染色质免疫共沉淀-测序）数据,以揭示p53的抑癌分子机制。从NCBI下载的编号为GSE47041的Ch IP-seq数据来源于三组试

【作者】

：

王立山祝鹏飞祁福娟曹鑫恺孔艳臧卫东

【机构】

：

上海丰核信息科技有限公司研发部

【出处】

：

生物信息学

【发表日期】

：

2014年4期

【关键词】

：

野生型p53乳腺癌MCF7细胞 P53 CH IP-seq数据通路富集分析蛋白互作网络 p53-WT MCF-7 breast cancer cells p

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采用生物信息学方法分析野生型p53乳腺癌MCF7细胞的Ch IP-seq（染色质免疫共沉淀-测序）数据,以揭示p53的抑癌分子机制。从NCBI下载的编号为GSE47041的Ch IP-seq数据来源于三组试验,分别为：未经处理的乳腺癌MCF7细胞对照（NS_input）,Nutlin-3a（一种MDM2拮抗剂）处理的MCF7细胞对照（S_input）和Nutlin-3a刺激MCF7细胞后加入p53抗体的实验组（S_p53）。Ch IP获得的DNA数据的测序平台为Illumina Hi Seq 2000。利

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