基于Perl脚本的大豆核苷酸序列高通量提取

来源 :南京农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：shuiqianzeqing

【摘要】

：

自从大豆全基因组测序完成和序列公布之后,阐明每个基因的生物学功能和调控网络成为当前的主要任务。基于Perl脚本开发了一套可以高通量、快速提取序列的程序,该程序可以批量

【作者】

：

张大勇王长彪易金鑫何晓兰马鸿翔

【机构】

：

江苏省农业科学院江苏省农业生物学重点实验室,山西省农业科学院棉花研究所,山西省农业科学院生物技术研究中心

【出处】

：

南京农业大学学报

【发表日期】

：

2012年1期

【关键词】

：

大豆全基因组序列提取序列分析液泡膜水通道蛋白 Perl程序 soybean genome sequence extraction sequence a

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自从大豆全基因组测序完成和序列公布之后,阐明每个基因的生物学功能和调控网络成为当前的主要任务。基于Perl脚本开发了一套可以高通量、快速提取序列的程序,该程序可以批量提取大豆染色体某个区间的核苷酸序列并利用其他工具进行批量分析,还可用于某个基因在全基因组中的所有序列分析。本研究分别对大豆第4染色体Glyma04g00930.1～Glyma04g01740.1区间的基因序列和水通道蛋白基因家族成员TIP（液泡膜水通道蛋白）序列进行提取。结果发现：Glyma04g00930.1～Glyma04g01740.1

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