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结构不定期能严重影响与三条隧道在 α-helix 蛋白质分子激动的 soliton 的运动的特征。我们由数字模拟和 Runge Kulta 方法在改进模型在 soliton 的特征上学习结构不定期的影响。结果获得了新 soliton 对包括在氨基酸的质量和春天常数的变化的顺序的大混乱的结构不定期是很柔韧的表演，联合常数，偶极子偶极子 interactional 常数，地面状态精力和链链相互作用。然而，很强壮的结构不定期能也在 α-helix 蛋白质分子破坏 solito