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结构关系模式挖掘是数据挖掘领域一个全新的分支，它包括并发关系模式挖掘、互斥关系模式挖掘、重复关系模式挖掘及有序关系模式挖掘。随着大量基因序列数据的获取人们正在研究各种方法从海量的基因数据中挖掘有用的信息。本文基干结构关系模式挖掘理论，对DNA序列从时间、空间、距离等不同角度分析了DNA序列中存在结构关系模式的可能性，并对生物信息的结构关系模式挖掘的约束条件进行分析。