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【目的】从分子水平上了解普通小麦-华山新麦草双二倍体（PHW-SA）合成过程中遗传变异情况。【方法】用195对引物对PHW-SA及其亲本普通小麦（J-11）和华山新麦草进行AFLP标记分析。【结果】J-11、华山新麦草和PHW-SA分别扩增出标记5 136、3 953和5 637条,分别占总标记（17 726条）的29.0%、22.3%和31.8%。81.8%的J-11标记和49.6%的华山新麦草标记存在于PHW-SA中。其中J-11与PHW-SA特有相同标记2 484条,分别占各自标记的48.4%和44