贵阳厌蚋全线粒体基因组及蚋科(双翅目:长角亚目)昆虫比较线粒体基因组分析

来源 :寄生虫与医学昆虫学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cxz2004
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为了解贵阳厌蚋Simulium guiyangense Chen, Liu and Yang, 2016全线粒体基因组的组成特征,明确蚋科昆虫的遗传多样性,探究其系统地位及蚋科昆虫内部的系统发育关系。本研究对贵阳厌蚋的线粒体基因组进行测序和注释,比较分析了已公布的蚋科昆虫线粒体基因组结构特征,并基于不同的数据集和方法对其系统发育关系进行了重建。贵阳厌蚋线粒体基因组序列总长为16 491 bp (GenBank登录号:ON227412),共包含13个蛋白质编码基因(PCGs)、22个tRNA基因、2个rRNA基因和一个控制区,碱基的含量分别为37.63% A、35.59% T、11.18% G和15.60% C。除COI使用TTG作为起始密码子外,其余均以ATN作为起始密码子。除ND4使用TAG作为终止密码子外,其余均采用TAA作为终止密码子。蚋科昆虫的蛋白质编码基因具有明显的AT偏向性,tRNASer(AGN)因缺少DHU臂均不能形成典型的三叶草结构,16S rRNA和12S rRNA多数位点变异率为0~25%。系统发育结果支持蛙蠓科Corethrellidae与蚊科Culicidae为姐妹群关系,奇蚋科Thaumaleidae和蚋科Simuliidae为姐妹群关系,蚋亚属Simulium为并系,与短蚋亚属Odagmia和厌蚋亚属Boophthora构成了布蚋亚属Byssodon的姐妹群。
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