【摘 要】
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目的分析天津市引起手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)的柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)VP1区基因特征。方法收集2013-2017年分离自天津市HFMD患者的CV-
【机 构】
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天津市疾病预防控制中心,天津,300011
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目的分析天津市引起手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)的柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)VP1区基因特征。方法收集2013-2017年分离自天津市HFMD患者的CV-A6毒株,采用RT-PCR扩增VP1区基因全长序列并测序,使用DNAStar 5.01软件进行同源性分析,使用MEGA 5.05软件进行基于VP1完整编码区的系统进化分析。结果 38株CV-A6分离株之间的核苷酸及氨基酸同源性分别为87.4%~100.0%和93.3%~100.0%;系统进化分析显示,38株CV-A6均为D基因型,其中2013年2株为D2基因亚型,其余36株均为D3基因亚型。D3亚型又可分为D3a和D3b2个进化分支,其中32株属于D3a分支,4株属于D3b分支。结论 2013-2017年天津市致手足口病CV-A6流行株主要为D2和D3基因亚型,D3基因亚型又包括D3a和D3b两个进化分支,并以D3a进化分支为主,且呈隔年高发态势。
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