【摘 要】
:
肠道菌群在炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)的发生和发展中扮演着非常重要的角色,补充益生菌有望成为缓解和治疗IBD的有效手段.本研究旨在利用高通量测序技术研究一株从节食小鼠肠道内分离的优势鼠乳杆菌(Lactobacillus murinus)CR147对葡聚糖硫酸钠(dextran sulphate sodium,DSS)诱导的慢性结肠炎小鼠肠道炎症及肠道菌群的影响.该菌株在先前的研究中已被证明有降低相关炎症的重要作用.给DSS造模完成后的小鼠灌胃CR147菌株,可
【机 构】
:
上海交通大学生命科学技术学院,微生物代谢国家重点实验室,上海,200240
论文部分内容阅读
肠道菌群在炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)的发生和发展中扮演着非常重要的角色,补充益生菌有望成为缓解和治疗IBD的有效手段.本研究旨在利用高通量测序技术研究一株从节食小鼠肠道内分离的优势鼠乳杆菌(Lactobacillus murinus)CR147对葡聚糖硫酸钠(dextran sulphate sodium,DSS)诱导的慢性结肠炎小鼠肠道炎症及肠道菌群的影响.该菌株在先前的研究中已被证明有降低相关炎症的重要作用.给DSS造模完成后的小鼠灌胃CR147菌株,可以加速疾病活动指数和小鼠粪便中指示肠道炎症的标志物Lipocalin-2水平的恢复,显著改善DSS导致的肠道菌群α多样性的下降.另外,基于Bray-Curtis距离的主坐标分析和多元方差分析(multi variate analysis of variance,MANOVA)表明,补充CR147菌株显著改变了小鼠肠道菌群的整体结构,并且肠道菌群组成在门和属水平上也与对照组有显著差异.通过稀疏偏最小二乘判别分析(sparse partial least squares discriminant analysis,sPLS-DA)模型鉴定出37个响应CR147菌株的可操作分类单元(operational taxonomic units,OUT),其中19个OUT的丰度在CR147组中显著增加,12个OUT丰度显著降低.综上,鼠乳杆菌CR147菌株能加快小鼠DSS诱导的慢性结肠炎的恢复并改变其肠道菌群,这些发现预示CR147菌株可能是通过调节肠道菌群来发挥抗炎效果.
其他文献
为了明确硼肥对甜荞植株构型及产量的影响,本研究以甜荞品种\'综甜2号\'为试验材料,在花蕾期对其叶片喷施不同浓度的硼肥,于成熟期测定甜荞根际土壤养分的含量、根系形态、农艺性状及产量.结果表明:硼肥的施用能显著增加\'综甜2号\'根际土壤铵态氮、速效钾含量,以及pH、根系表面积和根系体积,而且显著降低根际土壤有机质的含量.当硼肥用量为24 mg/L时,甜荞的产量最高达到734.30 kg/hm2,比对照增产12.47%.相关性分析表明:\'综甜2号\'的株高与产量呈显著正相关关系.通
水牛睾丸支持细胞(Sertoli cells)是环绕在精原干细胞(spermatogonial stem cells,SSCs)周围的一类体细胞,为SSCs增殖提供物理支持及稳定的环境,同时参与血睾屏障形成.支持细胞可分泌FGF2,从而提高SSCs存活和增殖.至今为止,水牛SSCs培养体系仍然面临许多挑战,推测内源性的FGF2可提高SSCs在体外培养时的自我更新和增殖能力.为此,本研究探索了水牛支持细胞的分离纯化方法,对比了幼年和成年水牛支持细胞FGF2的表达差异,并构建了支持细胞FGF2过表达细胞系.结
为了改良传统提取富含RNA酶大鼠胰腺和腮腺组织总RNA方法,本研究将组织样本分成对照组,0.5%,1.0%和2.0%β-巯基乙醇处理组,对照组采用Trizol法提取总RNA,β-巯基乙醇处理组分别于Trizol试剂中加入0.5%,1%,2%β-巯基乙醇.测定不同处理组单链核酸含量、完整性,A260/280和A260/230;采用实时荧光定量PCR检测管家基因β-actin,GAPDH,胰腺淀粉酶AMY2和腮腺水通道蛋白AQP-5表达情况,并通过计算扩增效率,验证β-巯基乙醇是否对后续PCR实验有影响.结果
为了实现食品中酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)和无乳链球菌(S.agalactiae)快速、高效检测,本研究建立了一种同时快速检测食品中这两种细菌的方法.本研究基于重组酶聚合酶等温扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA)原理,选择酿脓链球菌致热外毒素B基因(speB基因)和无乳链球菌表面免疫蛋白基因(SIP基因)的保守序列分别设计RPA引物和探针,分析检测方法的特异性和灵敏性,采用模拟污染实验验证检测效果.结果表明,检测时间为2
红曲霉(Monascus sp.)代谢产物具有很强的抗氧化性,是天然的抗氧化剂重要来源.金钗石斛是中国传统中药材,具有很多生物活性,结合红曲霉与中草药材双向发酵有望增强其抗氧化能力和改变代谢通路,为探究筛选最佳的金钗石斛-红曲霉发酵条件,提高双向发酵代谢产物的抗氧化活性,采用ABTS法、DPPH法和抗脂质过氧化法三种体外抗氧化模型,通过单因素实验确定影响抗氧化活性的发酵条件,然后设计了四因素三水平正交实验,确定了最优发酵条件为:接种量10%、料水比1∶0.7、培养时间16d和温度(28±1)℃.在此条件下
心肌梗死是一种急性及严重的心脏状态,心肌因无法得到足够氧气而导致的损伤.心肌梗死是一种死亡率极高的心脏状况异常,但如果急救及时,也是一种救治有效率极高病例,因此,心肌梗死的及时急救和治疗是非常重要的.本研究系统地综述了心肌梗死的诊断、急救和治疗,以期为医护工作者、社会大众和科研人员提供理论和实践指导.
荚膜多糖(CPS)是肺炎克雷伯菌(Klebssiella pneumoniae)重要的毒力因子.Rcs系统是肠杆菌科(En-terobacteriacese)中重要的双组分信号转导系统,RcsAB是其中主要的转录调控蛋白.本研究选取了肺炎克雷伯菌NTUH-K2044 cps基因簇上的3个基因(wcaJ,wcaG和magA),研究RcsAB对上述3个基因可能存在的调控关系.通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术和LacZ报告基因融合试验来确认RcsAB是否能够调控上述3个基因的转录表达.进而用凝胶阻滞
成功构建pET-24a-tscd质粒,实现Thermococcus sp.Strain B1001来源的环糊精酶(TsCDase)在Es-cherichia coli BL21(DE3)中表达.通过热处理和镍柱分离对重组TsCDase进行纯化.酶学性质研究表明,重组TsCDase的比活为1 208.04 U/mg,最适温度为90℃、最适pH值为5.5.重组酶TsCDase在85℃、90℃、95℃条件下的半衰期分别为180、120、30min.酶转化研究表明,以80 g/L β-环糊精为底物,当酶转化温度为
本研究基于GEO数据库,选取由慢性乙型肝炎诱导的肝细胞癌芯片数据GSE121248为研究对象,利用GEO2R软件分析数据,筛选出差异表达基因,利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG pathway富集分析.利用STRING数据库构建PPI网络,分析筛选核心基因.利用GEPIA对核心基因的表达进行验证,Kaplan Meier Plotter在线分析工具对核心基因与患者生存情况的相关性进行验证.通过上述方法筛选出309个DEGs,其中上调基因94个,下调基因215个.差异基因功能分析显示上调的DEGs主
基于质谱数据的蛋白质定量分析一直是目前高通量蛋白质组学的重要研究手段.但是基于现有质谱技术的限制,大规模蛋白质定量过程中往往会产生大量的缺失值,这在一定程度上影响了下游分析的准确性.尽管很多缺失值填补方法被不断提出,但是蛋白质组学领域对于不同情况下缺失值填补方法效力的综合评估仍然缺乏.本研究基于真实数据的分布特征,构建模拟数据集,在样本量、效应值以及缺失比例这三个维度上,综合评估了kNN、SVD、MLE、BPCA、LLS、Min、QRILC、Mean这8种缺失值填补方法的效力.结果显示,填补效力与样本量和