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闽台天然的“五缘”优势使双方在经济社会发展中常将对方视作重要参照系。比较两地应用型本科高校的发展现况、差异及成因，为两岸高等职业教育未来发展提供借鉴。研究发现，台湾应用型大学私校比例、学制畅通度及本科在校生占比较福建为高，两地高校要根据自身发展目标优化学历、学科、资源等结构布局；在科系、专业设置方面应当契合地方产业需求，适时调整具有前瞻性和弹性的人才培养方案；通过加强“双师型”教师队伍和“应用型”课程科研体系建设，解决技职师资学术化和人才供求矛盾问题；根据生源状况改革多元人学或归并招录方式。