【摘 要】
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许多研究表明,非编码RNA(lncRNA)是ceRNA网络的重要组成部分.lncRNA介导的ceRNA网络在甲状腺乳头状癌(PTC)淋巴结转移中的功能和调控机制尚不清楚.从TCGA数据库中,分析了133
【机 构】
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贵州省人民医院核医学科 550002;贵州省人民医院呼吸内科 550002
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许多研究表明,非编码RNA(lncRNA)是ceRNA网络的重要组成部分.lncRNA介导的ceRNA网络在甲状腺乳头状癌(PTC)淋巴结转移中的功能和调控机制尚不清楚.从TCGA数据库中,分析了133个PTC组织的mRNA,miRNA和lncRNA. 使用R包edgeR计算它们之间的差异表达谱.使用R包WGCNA获得它们的共表达关系,并通过Cytoscape构建lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络.我们鉴定了17个lncRNA,2个miRNA和84个mRNA,它们之间的共表达关系非常复杂.在84个mRNA中,有18个被确定与肿瘤的生长、侵袭和转移有关.17个lncRNA中的MNX1-AS1和Linc00974基因在肿瘤细胞凋亡、增殖、进展、转移和复发中起重要作用.这些lncRNA在PTC也可能具有类似的功能,影响PTC的侵袭能力.这项研究更好地解释了PTC淋巴结转移的分子生物学机制.
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