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目的 比较研究转移性肝癌细胞系中蛋白质表达谱的改变,筛查在转移中起重要作用的关键蛋白质分子.方法用双向电泳(2-DE)及液相色谱-电喷雾-串联质谱(LC-ESI-MS/MS)对3种不同转移潜能人肝癌细胞系Hep3B、MHCC97L、MHCC97H的差异蛋白质组进行分析. 结果 Hep3B、MHCC9TL和MHCC9TH分别平均检测到976±112个蛋白点(n=3)、1092±40个蛋白点(n=3),和888±15个蛋白点(n=3),以其中MHCC97L图谱为参考胶,Hep3B、MHCC9TL和MHCC9TH分别与其匹配的平均匹配点数为637±37个(n=3)、771±16个(n=2)和589±51个(n=3),平均匹配率分别为65.7 %,72.1%,66.2%.不同胶间蛋白质斑点的位置偏差[等电聚焦(IEF)]方向为(2.95± 0.95)mm,聚丙烯酰胺凝胶电泳方向为(2.87±0.88)mm.Hep3B、MHCC97L、MHCC97H中有359个蛋白质点匹配.与Hep3B比,MHCC97L有103个点未匹配,相差10倍以上的上调点和下调点分别为57个和49个;MHCC97H有113个点未匹配,相差10倍以上的上调点有47个,相差10倍以上的下调点有52个.质谱可鉴定出S100A4,S100A6,S100A11,Annexin1等26种胶内差异蛋白质.结论与不转移肝癌细胞相比,转移性肝癌细胞有明显的差异性蛋白表达谱.推测肝癌侵袭转移性与细胞内多种差异蛋白相关。