故事发生在距今并不遥远的2019年。主人公林肯6-E和几百个伙伴生活在一个类似于乌托邦的地下社会中。在他们周围，是先进的精密仪器和高效智能的防御系统，这些保障了他们有条不紊的生活节奏。虽然终年不见天日，但他们只能忍受，因为根据基地科学家的描述，在他们的头上，整个星球已经彻底被核战污染，没有任何生物能够在星球表面生存。
　　乌托邦的生活虽然一切井井有条，但自然和自由更令人向往。所有基地的居民都盼望着一个抽签的机会，幸运者将被送到星球上最后一个未被污染的地方，即一个叫“The Island”的世外桃源。而这一次，获得这个机会的是林肯6-E的女朋友，美丽的乔丹2-D。
　　由于基地管理者的疏忽，一只外面世界的飞蛾飞进了这座封闭已久的地下城市，它的出现令林肯6-E疑窦顿生，因为按照基地管理者的说法，所有的生物都在核战中灭绝了。在飞蛾的带领下，林肯6-E来到了基地的中心，在那里，他看到自己从前被选中前往“The Island”的朋友斯塔克威泽。基地的科学家正为斯塔克威泽施行手术，他的器官被取出送出基地。至此，林肯6-E终于明白：自己的生活其实是一个巨大的谎言，他们都是被克隆组织控制的克隆人，他们存在的意义只是为本体提供新鲜健康的器官，他们死后的价值远比生前更高。
　　得知真相的林肯6-E带着乔丹2-D逃离基地，进入他们从未涉足的现实生活之中。他要前往洛杉矶找到自己的本体，解开关于自己身世的最后的秘密。而此时，国家特工和基地组织的杀手已将他们锁定为最危险的目标，一场猎杀和抗争、追逐与逃脱拉开了序幕……林肯6-E与乔丹2-D只有一个目标，那就是活下去……
　　鉴赏空间
　　这是一部科幻电影，它不禁使我们想起《奇妙的克隆》结尾处所说的：“科技进步是一首悲喜交集的进行曲。科技越发展，对社会的渗透越广泛深入，就越有可能引起许多有关的伦理、道德和法律等问题。”如果有一天真的可以克隆人，那会是一个怎样的情景呢？我们该如何对待克隆人呢？
　　[读有所思]
　　请你设想一下，我们该如何让克隆技术造福世界？我们该如何控制和防止克隆技术走向反面呢？