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为了探寻枯草芽孢杆菌S6菌中对棉花枯萎病菌有拮抗作用的蛋白,将S6菌进行液体发酵培养,初步提取得到了粗蛋白提取液。粗提液经硫酸铵沉淀、Sephadex G-50脱盐、Sephadex G-100凝胶层析、DEAE-52纤维素离子交换层析,得到了对棉花枯萎病菌有高效拮抗作用的蛋白质,纯化倍数达17。形成分离纯化S6菌株的棉花枯萎病菌拮抗蛋白的可靠技术路线,为研究和生产防治棉花枯萎病菌的生物制剂提供了理论基础。