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目的:研究云南地区人群FOXE1基因rs944289多态性与甲状腺乳头状癌的相关性。方法:随机抽取云南地区无血缘关系汉族甲状腺乳头状癌(papilliary thyroid carcinoma,PTC)患者88例、甲状腺腺瘤(thyroid adenoma,TA)患者84例和正常对照者(normal control,NC)92例,抽提外周血基因组DNA。采用应用TaqMan探针基因分型方法检测FOXE1基因rs944289多态性。结果:rs944289基因T位点携带者转移的几率较C位点携带者高4.84倍(OR=4.84,95%CI=1.597-14.668,P=0.005)。rs944289 C>T基因多态性在甲状腺乳头状癌的遗传易感性与甲状腺腺瘤及健康人的差别有统计学意义(P=0.031,P=0.006)。并且在女性中的分布有显著差异。PTC组与NC组FOXE1基因rs944289序列CC、TC及TT的基因型频率分布有显著统计学差异(P=0.022)。结论:FOXE1基因rs944289多态性中的T等位基因可能是PTC易感且转移的危险因素。