新型鸭呼肠孤病毒QY株σB蛋白基因特征、二级结构预测及其细胞抗原表位分析

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户：renrenxiaonei

【摘要】

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本研究旨在对新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)QY株σB蛋白的遗传变异规律和结构及功能进行分析。从GenBank数据库中获取QY株和25株参考株的σB蛋白编码序列,通过Mega 6.0软件进行序列

【作者】

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吴阳开范文胜张雪莲李智丽郭锦玥李文锋

【机构】

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广东容大生物股份有限公司,广西大学动物科学技术学院,佛山科学技术学院生命科学与工程学院

【出处】

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中国畜牧兽医

【发表日期】

：

2019年10期

【关键词】

：

新型鸭呼肠孤病毒(NDRV) σB蛋白基因特征二级结构抗原表位

【基金项目】

：

广东省水禽产业技术体系创新团队项目;广东省教育厅预防兽医学重点实验室项目(2014KTSPT037);佛山科学技术学院动物新发疫病防控重点实验室开放基金(KLPREAD201801-08)

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本研究旨在对新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)QY株σB蛋白的遗传变异规律和结构及功能进行分析。从GenBank数据库中获取QY株和25株参考株的σB蛋白编码序列,通过Mega 6.0软件进行序列比对分析和系统进化树构建;使用Datamonkey软件进行选择压力分析;运用生物信息学软件预测QY株σB蛋白二级结构功能及B细胞和T细胞抗原表位。相似性分析结果显示,NDRV QY株与国内其他地区分离的鸭呼肠孤病毒(DRV)氨基酸相似性达到94.9%~98.9%,与禽呼肠孤病毒(ARV)及番鸭呼肠孤病毒(MDRV)的相

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