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高等教育评估制度是我国现代大学制度的有机组成部分，二者在价值取向以及制度主体等方面具有内在的一致性但由于传统高等教育体制的行政“惯性”以及评估制度本身还很不健全，高等教育评估制度在实践中常常表现为与现代大学制度的背离与冲突，当务之急是要通过正确定位政府在高等教育评估中的职能、建立内外结合的评估机制以及加强中介评估机构建设等途径，推进高等教育评估制度创新．