【摘 要】
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目的 建立体外获得突变型p53蛋白DNA适配子(aptamers)的方法,为该适配子在肿瘤早期诊断及靶向治疗运用中奠定基础.方法 构建长度为75 nt的初始随机单链DNA库,其两端为固定序
【机 构】
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武汉市第九医院外科,肿瘤生物学行为湖北省重点实验室
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目的 建立体外获得突变型p53蛋白DNA适配子(aptamers)的方法,为该适配子在肿瘤早期诊断及靶向治疗运用中奠定基础.方法 构建长度为75 nt的初始随机单链DNA库,其两端为固定序列,中间为35个随机序列,库容量为1 × 1017～1×1018,以溴化氰活化的琼脂糖小球为筛选介质,运用指数富集的配体系统进化技术(SELEX技术)经逐轮筛选获得突变型p53蛋白的DNA适配子.将适配子库克隆、测序,采用DNAMAN软件对其结构进行分析,通过生物素-亲和素-辣根过氧化物酶显色系统测定适配子与突变型p53蛋白的亲和力.结果 经逐轮筛选,所得适配子富集库与突变型p53蛋白的亲和力逐步提高,A450值从0.1357增加到了0.6818,其亲和力至第8轮筛选达最高水平后进入平台期.克隆第8轮筛选适配子库,测定23个克隆子的序列,其中20个克隆子的序列与预期相符.DNAMAN5.29软件分析表明,20个克隆子的一级序列同源率为76.51%,无共同保守序列,适配子的二级结构则以茎环、凸环结构为主.结论 经8轮筛选获得的DNA适配子与突变型p53蛋白的体外结合具有高度的特异性及亲和力,其克隆子无共同保守序列,适配子的高亲和性与其形成的茎环、凸环等空间结构密切相关.
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