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2011年8月对镜泊湖浮游植物类群结构组成、优势类群及细胞密度进行了调查，结果表明镜泊湖浮游植物有8门，54种，种类最多的为绿藻门，共鉴定出20种，其次为蓝藻门和硅藻门，分别鉴定出13种；湖口、湖中和湖尾3断面浮游植物细胞密度分别为10．06×106个／L、6．01×106个／L和1．67×106个／L；优势的种类为蓝藻门的微小平裂藻、假鱼腥藻、罗氏藻，以及硅藻门的梅尼小环藻、钝脆杆藻，3断面中所占的比例均不相同；浮游植物多样性指数上游较高，中下游较低，说明镜泊湖水体质量存在