【摘 要】
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目的 通过研究冠心病血浆外泌体的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,circRNA)的表达和富集通路,探讨冠心病的发病机制.方法 从exoRBase数据
【机 构】
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广西医科大学第一附属医院肾内科,广西 南宁530021
【出 处】
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目的 通过研究冠心病血浆外泌体的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circular RNA,circRNA)的表达和富集通路,探讨冠心病的发病机制.方法 从exoRBase数据库下载冠心病患者的lncRNA、circRNA和信使RNA(messenger RNA,mRNA)表达谱,用T检验分析获得冠心病中差异表达的mrna、lncrna、circrna(DEmrna、DElncrna、DEcircrna).分别使用Targetscan human7.2、miRanda、ENCORI、miRcode预测差异表达的mrna、lncrna、circrna与微小RNA(microRNA,miRNA)之间的靶向调控关系,建立ceRNA网络.最后,对差异表达的mRNAs进行GO和KEGG通路分析.结果 差异分析得到52个差异表达mRNAs,24个差异表达lncRNAs,85个circRNAs.通过软件预测结果取交集再筛选出4lncRNAs,5 circRNAs,18 miRNAs和5 mRNAs用于构建竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络.GO和KEGG功能分析显示这些差异mRNAs主要和肿瘤坏死因子介导的信号通路的调控、丝裂原活化蛋白激酶通路(MAPK通路)的生物学过程有关.结论 外泌体中的微小RNA可能通过影响炎症和氧化应激参与到冠心病的发生发展中,本研究可为冠心病的诊疗提供新思路.
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