为了掌握广西猫杯状病毒（FCV）的流行情况及其变异规律。本研究于2018年3月至2019年9月采集疑似FCV鼻拭子59份，其中阳性检出率49.2%（29/59）。将阳性病料接种CRFK细胞，成功分离获得一株FCV毒株，命名为NN01-19。为深入了解其遗传进化规律和分子特征，本研究通过RT-PCR方法扩增获得该毒株的全基因组序列，并对其ORF2基因进行了遗传进化和序列分析。结果表明，NN01-19毒株基因组全长7709 bp，其中ORF2基因全长2010 bp。遗传进化分析发现该毒株与广西早期分离株GX01-13同属基因I群，但核苷酸和氨基酸同源性仅为77.9%和86.5%。其中，超变区（E区）抗原线性表位新增T448A、T450G、G451Q和T454S四个突变位点。重要的是，该区域还发生了V430T的突变，符合VS-FCV致病性氨基酸突变特点。本研究为深入了解FCV的流行特点及其变异规律提供了参考依据，同时也为今后防控FCV提供了重要的理论基础。