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将以原油驯化所得的纯培养微生物菌株作为模板,采用PCR（聚合酶链式反应）法,用扩增细菌16S rDNA的一对通用引物（8 f,1492 r）对模板扩增,并用限制性内切酶R saI和M spI对PCR产物进行ARDRA多态性分析。聚类去除重复菌株后60株菌株可分为11种不同分类操作单元（OTU）,同时得出每个分类操作单元的数量。实验结果表明,此方法可快速去除重复菌株并反映出菌株间的系统进化关系;同时实验数据可构建成库,使后续分离菌株的筛选工作只需比对数据即可完成。