基于非负矩阵分解模型构建胃癌分子分型及预后评估的案例分析

来源 :上海交通大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:camelwin2000
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目的 ·探究基于非负矩阵分解(NMF)模型构建胃癌分子分型对预后评估的作用。方法 ·从GEO下载胃癌样本转录组芯片数据集分别作为探索集和验证集,挖掘lnc RNA数据集,利用Consensus Cluster Plus软件包构建NMF分子分型模型。评估各亚组与患者预后及各项临床指标的相关性。结果 ·基于NMF模型将所有样本分为高危、中危和低危3个亚组。结合临床病理信息,发现复发时间、淋巴结转移阳性率、Lauren分型、TNM分期、发病年龄在3个亚组间的分布差异具有统计学意义。
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