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【目的】研究蛋鸡MHC（Major Histocompatibility Complex，主要组织相容性复合物）基因对不同周龄和不同部位肠道细菌种群结构的影响。【方法】使用基于16srDNA的PCR-DGGE技术，结合特异性和共性条带割胶回收DNA进行克隆和测序，对2，4，6和8周龄商品蛋鸡和15I，系蛋鸡嗉囊、十二指肠、空肠、回肠和盲肠内含物细菌群落的结构和多样性进行比较，鉴定8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员。【结果】商品蛋鸡和15I，系蛋鸡盲肠细菌的多样性最高，其次是回肠和空肠，嗉囊和十二指肠的细菌