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目的 了解基本医疗保障制度在新疆维吾尔自治区基层住院患者中的覆盖情况.方法 调查基层医院2006 -2009年出院患者33 161例的医疗费用报销方式.结果 乡镇卫生院出院患者中97.1％为新型农村合作医疗,县级医院自费医疗比例由2006年的67.5％降到2009年的22.6％、新型农村合作医疗由0.5％增加到66.0％；学龄前儿童73.3％为自费医疗,46.0％学生为商业保险,青中年患者中自费医疗和国家基本医疗保险各占45.0％左右,老年患者中国家基本医疗保险在70.0％左右.结论 新型农村合作医疗已在新疆维吾尔自治区农牧区广范覆盖,县级医院2006年到2009年自费医疗明显下降、新型农村合作医疗明显增加,随年龄增长自费医疗也逐渐减少、国家基本医疗保险逐渐增加。