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目的：对松果菊属3种药用植物进行DNA指纹图谱鉴别，筛选出稳定的鉴别引物。方法：RAPD。结果：共筛选随机引物160个，3种松果菊中，狭叶松果菊与淡紫松果菊的RAPD图谱极其相似，难以区分。最终仅筛选得到一个可用于鉴别的随机引物H07。结论：引物H07可用于3种松果菊的原植物与药材鉴别，狭叶松果菊与淡紫松果菊具有明显较近的亲缘关系。