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乔姆斯基认为语言是一种心智器官，语言学可采用一种自然主义的研究，人们对大脑的研究就是对自然世界的某种侧面的研究，包括人们传统上所称的精神现象、过程和状态，通过建立清楚的解释性理论来对这些现象加以深刻的理解并进行高层次的研究。乔姆斯基“语言学是自然科学”的学说既有一定的进步性，即把研究对象从研究语言转移到研究人脑（普遍语法）是语言学的一大进步，同时也存在一些缺陷，即乔姆斯基的语言学的创见和发展的逻辑基础都是类比，用自然科学中已有的系统和实证科学来研究人脑得不到很好的解释。