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目的:借助多组学策略观察肿瘤-睾丸抗原联蛋白 α2(catenin alpha 2,CTNNA2)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达情况,探讨其在HCC免疫治疗中的潜在价值及临床意义.方法:分析CTNNA2在159例乙型肝炎病毒(HBV)相关HCC和配对癌旁组织中,mRNA和蛋白的表达水平及差异,并进一步采用免疫蛋白质组学检测与主要组织相容性复合体Ⅰ(major histocompatibility complex,M HC-Ⅰ)结合的CTNNA2抗原多肽.采用反转录多聚酶链反应(RT-PCR)验证33对HCC和癌旁组织cDNA及12种HCC细胞株中CTNNA2的表达情况,同时探讨CTNNA2参与肿瘤调控的可能机制.结果:转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-Seq)定量转录组学和串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)定量蛋白质组学结果均提示,CTNNA2在HCC组织中显著高表达.RNA-seq结果提示,CTNNA2表达阳性率为80.5％,较癌旁表达高11.24倍(P<0.001),TMT定量蛋白组学显示,HCC癌组织中CTNNA2表达阳性率为54.7％,较癌旁表达高2.66倍(P<0.001).经免疫蛋白质组学检测,本研究发现30种可能与M HC-Ⅰ结合的CTNNA2抗原多肽.结论:多组学研究结果提示,CTNNA2在HCC中高表达,CTNNA2可能是新的肝癌疫苗靶分子.