【摘 要】
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[目的]探究蓖麻LBD转录因子基因家族的组成和表达模式.[方法]通过生物信息学手段,在全基因组水平上筛选和鉴定蓖麻LBD基因家族成员,并对其基因结构、理化性质、蛋白质保守基序、进化选择压力、系统发育树和基因表达量进行分析.[结果]鉴定得出30个蓖麻LBD基因家族成员在进化过程中高度保守,根据LBD结构域和系统发育树分析的特征,将蓖麻LBD基因家族成员分为Class 1和Class 2两类,各有24个和6个.基因结构与蛋白质保守基序分析表明,蓖麻LBD基因家族成员的基因结构与蛋白质保守基序较为简单;亚细胞定
【机 构】
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内蒙古民族大学蓖麻育种国家民委重点实验室,内蒙古通辽 028043;中国科学院长春光学精密机械与物理研究所应用光学国家重点实验室,吉林长春 130000;内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心,内蒙
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[目的]探究蓖麻LBD转录因子基因家族的组成和表达模式.[方法]通过生物信息学手段,在全基因组水平上筛选和鉴定蓖麻LBD基因家族成员,并对其基因结构、理化性质、蛋白质保守基序、进化选择压力、系统发育树和基因表达量进行分析.[结果]鉴定得出30个蓖麻LBD基因家族成员在进化过程中高度保守,根据LBD结构域和系统发育树分析的特征,将蓖麻LBD基因家族成员分为Class 1和Class 2两类,各有24个和6个.基因结构与蛋白质保守基序分析表明,蓖麻LBD基因家族成员的基因结构与蛋白质保守基序较为简单;亚细胞定位显示,蓖麻LBD基因家族成员全部定位于细胞核,RcLBD12同时也定位于细胞膜.表达量数据分析表明,在蓖麻中,LBD基因家族成员广泛参与叶、茎、根、胚等的发育调控并响应非生物胁迫.[结论]蓖麻LBD基因家族成员在进化历程中出现了大规模片段复制的情况,经历了较强的纯化选择,并且参与调控蓖麻多个组织部位的生长发育过程,其中RcLBD6与RcLBD27可能在蓖麻抵御非生物胁迫的过程中发挥了重要作用.
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