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采用MATLAB统计工具箱中系统聚类分析法编程进行了京杭运河(常州市区段)水质监测断面的优化设置。分类结果直观,优化计算过程体现了MATLAB监测断面聚类分析程序简便、快速、可视化的优点,此程序可应用于大气、土壤、噪声环境监测站位的优化设置中,也可作为环境管理信息系统的一个子系统,具有良好的推广价值。