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消化系统疾病与全身性疾病关系密切。消化系统疾病可有消化道外其他系统或全身表现，甚至在某个时期内会掩盖本系统的基本症状；而全身疾病常以消化系症状为其主要表现，或者消化道病变仅是全身疾病的组成部分之一。因此，消化疾病的诊治必须具备坚实的临床基础，掌握消化系统病理变化特点，着眼于动物整体，进行整体与局部相结合的诊治。