HRNT-1(人ZA73)基因的识别

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HRNT-1(人ZA73)基因的识别 伴随着大规模测序技术的运用,EST Proiect应运而生,大大地加快了人类基因组计划的步伐。新发现的EST正以每月10万条的速度递增,为全长基因的克隆及功能研究提供了极大的方便,尤其是疾病基因的识别。 本实验室对辐射诱发肺癌相关基因在肺癌中的作用及机理进行了大量的基础及临床研究。ZA73(GenBank Accession Number:AF011363)是本实验室从大鼠肺上皮恶性转化细胞模型中采用mRNA差异显示技术克隆到的EST片段之一。经Northern杂交证实,与正常RTE细胞相比,该基因在RTE恶性转化细胞中存在相对较高的表达。同源性检索显示为新EST序列。在此基础上,本研究开始了HRNT-1 (人ZA73)基因的全长克隆及其相关功能的初步识别。 根据大鼠EST序列,本研究运用了基因捕获、cDNA快速终末端扩增等先进手段,成功地获得了含有完整开放阅读框架的HRNT-1 (人ZA73)序列。主要结果如下: 1.HRNT-1(人ZA73)cDNA总长4.256 kb。开放阅读框架2975 bp,位于28-3104 bp区域,起始密码子ATG,终止密码子TAA。编码区内含有9个TPR序列(tetratricopeptide repeat)。5’非编码序列253 bp;3’非编码序列1240 bp。5’端未见启动子序列,3’端未见PloyA序列。该基因已被GenBank收录,编号为AF223393。 2.通过互联网检索GenBank Nr数据库,与HRNT-1(人ZA73)同源性非常高的几条基因均是1999年登录于GenBank Nr数据库的。德国肿瘤研究中心分子基因组研究室先后于今年5月21、27日登录了两条基因,它们是AL050366.1(GI:4914599)、AL049950(GI:4884197),长度分别为2011bp、5537 bp的人cDNA序列。美国NIH细胞生物及生物化学实验室于今年5月19日和10月12日登录了OGT NM003605.1 (GI:4505498)、OGTNM003605.2(GI:6006036),长度分别为3084 bp、5733 bp。HRNT-1(人ZA73)基因、AL049950基因、OGT NM003605.1、NM 003605.2基因四者的开放阅读框架完全一致。人ZA7 3与后两者的差异处在于3’非编码区序列相对较长。 3.RT-PCR显示,HRNT-1(人ZA73)基因在人支气管上皮BEP2D恶性转
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