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中药品种保护制度是我国中医药保护法律体系中的一种特有设计。它针对中成药采用了分而治之的管理策略,一级保护适用商业秘密手段,二级保护具备市场准入的性质,其制度设置具有弥补中药专利化不力的功能。然而在运作中该制度却存在与中药专利及中药标准混用甚至重叠的事实,其内在功能未得到有效发挥。制度完善的基础则在于厘清专利药与非专利药保护策略的区别,有效借助公权力以实现品种保护对中药专利制度的有效互补。