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针对实际扫描型亚像元热成像系统可能存在探测器填充率不为1以及微扫描对位偏差，研究了填充率不为1以及存在微扫描对位偏差条件下的亚像元热成像处理算法，证明通过适当的亚像元处理技术依然可获得高分辨力的亚像元成像；给出了适合实时处理的快速处理算法；分析了填充率和对位偏差对亚像元处理图像的影响，为实际亚像元成像系统的装配以及处理算法的调试提供了理论指导．算法的实现对提高扫描型热成像系统的技术性能指标具有重要意义．